Интенсив по биоинформатике: геномный проект (апрель 2015)
Санкт-Петербург, 10-12 Апреля 2015
Интенсив будет интересен тем, кто хочет в сжатые сроки получить максимум практических навыков по работе с геномными данными.
К участию приглашаются исследователи биологических направлений, заинтересованные в изучении методов ведения геномных проектов: обработки данных секвенирования, аннотации генов, поиске вариаций и других.
Формат
Трехдневный интенсив построен по модульной системе: в каждой части последовательно рассматриваются отдельные стадии ведения геномного проекта. Бóльшую часть курса занимают практические занятия.
По итогам участники получат не только общие представления о методах работы с геномными данными (как бактериальными, так и человеческими), но и пройдут все важнейшие методы работы на практике. На интенсиве также будет возможность получить консультацию по своим научным проектам.
Рабочий язык -- русский.
Программа
- Секвенирование, базы данных
- Работа на удаленных серверах
- Контроль качества
- Сборка геномов
- Аннотация геномов, поиск генов
- Выравнивание последовательностей, поиск полиморфизмов
- Обзор областей геномной биоинформатики
Лекторы
Занятия проведут ведущие научные сотрудники биоинформатических лабораторий Санкт-Петербурга. На данный момент подтвердили свое участие:
- Алла Лапидус, СПбГУ, СПбАУ РАН
- Алексей Гуревич, СПбАУ РАН
- Алексей Комиссаров, СПбГУ
- Андрей Пржибельский, СПбАУ РАН
- Антон Брагин, Parseq Lab
- Михаил Райко, СПбГУ
- Павел Добрынин, СПбГУ
Требования к участникам
- Профильное образование и/или существенный опыт биологических исследований.
- Уверенная работа в командной строке Linux. Заблаговременно овладеть этими знаниями можно, пройдя первые две недели бесплатного онлайн-курса "Основы Linux" от Института биоинформатики.
Проводится конкурсный отбор, максимальное количество участников – 20 человек.